Die Häfen waren stets die Lebensader Bremens und haben über Jahrhunderte die Identität der Stadt geprägt. Im denkmalgeschützten Speicher XI bildet das Museum die Schnittstelle zwischen der Vergangenheit und der Zukunft: Es ist Teil der sich wandelnden Überseestadt und vermittelt die stadtplanerische Entwicklung ebenso wie Aktivitäten der bremischen Hafenwirtschaft und den steten Wandel und Fortschritt in allen maritimen Bereichen.

Das Hafenmuseum zeigt Geschichte mit Ausblick – es ist dem Hafen, seiner Geschichte, Gegenwart und Zukunft verpflichtet.